dimple
1.0.0
大分子晶体学管道用于细化和配体筛选。
Dimple是CCP4套件的一部分。所有工作都是由套件的其他程序完成的,这些程序在下面运行。最重要的是RefMac和Phaser 。因此,您需要安装CCP4。
要测试最新的开发版本,请克隆此存储库并运行./dimple/dimple
。
Dimple带有一点find-blobs
实用程序。如果您不编译它,则将使用CCP4套件的版本。汇编需要剪裁库,依次需要MMDB2和LIBCCP4。您可以构建从源来构建所有内容,或者使用Conda下载使用GCC 4.8编译的二进制文件。后者可以通过安装minconda并进行:
conda install -c mw clipper
而不是构建查找键指向所需库的位置:
export CXXFLAGS="-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 -std=c++98" # for GCC 5
cmake -D CMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/miniconda2 .
make
无需进行安装 - 与Python脚本和DIMPLE相同的目录中的二进制降落在此目录中,将首先使用$CCP4/bin
的程序。
如果不起作用 - 请参见下面的联系方法。
欢迎任何想法,评论或反馈。如果它无法正常工作或根本不起作用 - 请尽快知道。使用问题跟踪器或电子邮件CCP4帮助台或发送电子邮件至[email protected]或。
用钻石光源和CCP4-Harwell制造。