tIGAr

蒂加尔

使用Fenics用于等几何分析（IGA）的Python库。以下文章概述了Tigar的设计：

 @article{Kamensky2019,
title = "{tIGAr}: Automating isogeometric analysis with {FEniCS}",
journal = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
volume = "344",
pages = "477--498",
year = "2019",
issn = "0045-7825",
doi = "https://doi.org/10.1016/j.cma.2018.10.002",
author = "D. Kamensky and Y. Bazilevs"
}

依赖性

• 任何有意义的用法都需要Fenics（2019.2版）及其依赖性。
• 需要Scipy。 （Scipy已经包含在Fenics Docker发行中。）
• 使用NURBS模块需要Igakit。
• 编译API文档需要狮身人面像。
• 可视化结果的最方便程序是浏览器。

安装

安装所有依赖项，克隆存储库（或从存档中下载和提取），然后将存储库的顶级目录（即带有tigar subdectories tIGAr ， docs等）的顶级目录附加到环境变量PYTHONPATH ，例如，例如，例如添加

 export PYTHONPATH=/path/to/repository/: $PYTHONPATH

到您的~/.bashrc文件（以及source -ing it）。 （可选地）构建API文档，将目录更改为docs并键入make html 。然后，主要文档将在./_build/html/index.html中，可以使用Web浏览器打开。

在集群上

在HPC群集上使用Fenics（以及Tigar）的最方便方法是通过奇异性。用于使用Tigar的奇异性配方是在文件singularity-recipe.def中。该文件的评论中还提供了一些其他注释。

常见的安装问题

• petsc4py.PETSc.Mat object has no attribute PtAP ：这是由于petsc4py的旧版本所致。尝试通过pip3安装最新版本。
• ImportError: No module named dolfin ：尝试使用python而不是python3时会发生这种情况。 Fenics 2018.1和新的不再支持Python 2。
• Python.h: No such file or directory ：这需要安装Python C API的标头文件。在Ubuntu上，可以通过sudo apt-get install python3-dev安装它们。
• ModuleNotFoundError: No module named 'scipy._lib.decorator' ：尝试重新安装scipy，可以使用command pip3 install --force-reinstall scipy来完成。
• 由于旧版本的Fenics：在终端中运行dolfin-version引起的错误，以检查您的Fenics版本。特别注意，仅在最近的少数Ubuntu发行版中维护了当前稳定版本的Fenics的Ubuntu PPA。通过包装管理器在旧的Ubuntu版本上安装，可能会安装旧版本的Fenics。
• 使用奇异容器时， libgfortran.so.3 cannot be found或libgfortran的其他问题：尝试在文件singularity-recipe.def中的%post部分下添加apt-get -y install libgfortran3 。