青光眼資料集元數據

新更新

• 24 年 8 月 3 日：新的摘要向公眾開放，介紹了一種青光眼檢測的新方法：青光眼檢測的視網膜血管評估：人類專業知識和深度學習演算法的比較分析。
• 24 年 5 月 15 日：Kaggle 上的 EyePACS-light-V2 程式碼資料夾有一個新的 PyTorch 模板，可快速、輕鬆地設定青光眼檢測。模型使用輕量級的MobileNetV3，測試準確率達到92.6%：https://www.kaggle.com/code/deathtrooper/pytorch-easy-setup-for-glaucoma-detection-92-6
• 24 年 3 月 9 日：EyePACS-light-V2 現在的 Kaggle 可用性評分為 10.0：補充的metadata.csv 檔案已新增至資料集。
• 24 年 1 月 20 日：如果您對資料集的衍生方式感到好奇，現在可以在「關於」部分（一直向下滾動）的 Kaggle 資料集連結上取得 EyePACS-light-V2 預處理進階概述
• 23 年 12 月 28 日：使用 ConvNeXtTiny 的 EyePACS-light-V2 94.94% 測試精準度基準：https://www.kaggle.com/code/deathtrooper/benchmark-94-94-convnexttiny
• 23 年 12 月 12 日：EyePACS-light-V2 就在這裡！成為第一個使用這個改進的資料集對您的模型進行基準測試的人！從kaggle下載：https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light-v2/data

引文註釋

如果您發現本目錄有幫助，請考慮引用以下內容：

• 萊利·基弗、穆罕默德·阿比德、傑西卡·斯蒂恩、馬赫薩·雷西·阿達利和埃桑·阿姆賈迪安。 2023. 用於機器學習應用的公共青光眼資料集目錄：對公共青光眼資料集的詳細描述和分析，可供機器學習工程師使用視網膜眼底影像和 OCT 影像解決青光眼相關問題。 2023 年第七屆國際資訊系統與資料探勘會議 (ICISDM '23) 論文集。電腦協會，美國紐約州紐約市，24-31。 https://doi.org/10.1145/3603765.3603779

公共青光眼資料集目錄

[透過提供新青光眼資料集的連結/出版物來幫助擴展此存儲庫！ ]

儲存庫目錄

• README.md：青光眼概述、相關研究和資料集訪問鏈接
• benchmark-eyepacs-airogs-light.md ：使用 EyePACS-AIROGS-light 資料集的訓練/驗證集進行測試集評估的排行榜
• summary.md ：資料集類別細分、影像類型和青光眼類型
• data-availability.md ：資料集影像與分割可用性。
• origin.md ：資料集收集來源和收集年份。

青光眼概述

根據 AAO 的說法，「青光眼是一種損害眼睛視神經的疾病。它通常發生在眼睛前部積聚液體時。多餘的液體會增加眼睛的壓力，從而損害視神經」。它是失明的主要原因，如果不及時治療，情況會隨著時間的推移而惡化。驗光師透過眼底影像（眼睛的 2D 影像）或眼相干斷層掃描 (OCT) 影像（眼睛的 3D 影像）來診斷青光眼。在眼底影像中，驗光師通常會尋找視杯或視盤損傷。在 OCT 影像中，驗光師通常會尋找層萎縮。為了自動偵測青光眼，我們為機器學習整理了資料集。眼底影像資料集通常設計用於青光眼分類以區分健康的青光眼或視神經乳頭分割以提取和分析視杯或視盤損傷。 EyePACS-AIROGS-light 等高品質基準資料集具有預先確定的訓練、驗證和測試集，以實現可重複性。

相關青光眼資料集（由我提供）

• SMDG-19 [資料集]，“青光眼標準化多通道資料集，版本 19”，https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/multichannel-glaucoma-benchmark-dataset
• EyePACS-AIROGS-light-v1 [資料集]，“EyePACS 人工智慧用於穩健的青光眼篩檢挑戰，輕量級版本1”，https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/eyepacs-airogs- light
• EyePACS-AIROGS-light-v2 [資料集]，“EyePACS 人工智慧用於穩健的青光眼篩檢挑戰，輕量級版本2”，https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset- eyepacs-airogs-light- v2

相關青光眼研究（我做）

• ARVO 2024 [摘要]，“青光眼檢測的視網膜脈管系統評估：人類專業知識和深度學習演算法的比較分析”，https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2794846
• AAO 2022 [摘要]，“用於自動青光眼檢測的公開青光眼數據集的綜合調查”，https://aaopt.org/past-meeting-abstract-archives/?SortBy=ArticleYear&ArticleType=&ArticleYear=2022&Title=ArticleYear&ArticleType=&ArticleYear=2022&Title=&Abstract=&Authors = &隸屬關係=&PROGRAMNUMBER=225129
• AAO 2023 [摘要]，“眼底血管在青光眼檢測中的預測能力”，被接受為 AAO 2023 的演講
• AAO 2023 [摘要]，“EyePACS-light：用於自動青光眼分類建模的輕量級平衡數據集”，被接受為 AAO 2023 海報
• ARVO 2023 [摘要]，“用於青光眼檢測的人工智慧模型中使用的公開資料集的地面實況驗證”，https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2791017
• ARVO 2023 [摘要]，“用於人工智慧應用的標準化和開放存取青光眼資料集”，https://iovs.arvojournals.org/article.aspx?articleid=2790420
• IEEE-IEMCOM 2022 [全文]，“使用眼底和 OCT 影像的青光眼檢測演算法的調查”，https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/9946629
• IEEE-ICIVC 2023 [全文]，“使用動態全局前景閾值演算法實現自動眼底圖像標準化”，https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/10270429
• ICISDM 2023 [全文]，“機器學習應用的公共青光眼資料集目錄”，https://dl.acm.org/doi/abs/10.1145/3603765.3603779

範例數據

德里什蒂-GS	G1020	ORIGA-光	避難所1-VAL	帕皮拉

用例首字母縮略詞

• 分類
  • BGC = 青光眼二元分類（健康與青光眼或非青光眼與青光眼）
  • MGC = 多種青光眼分類（至少 2 種青光眼類型，包括疑似青光眼）
• 分割
  • ODS = 視盤分割
  • OCS = 視杯分割
  • BVS = 血管分割
  • OLS = OCT 層分割
  • RNFLS = 視網膜神經纖維層分割
• 其他
  • LT = 本地化任務
  • IQA = 影像品質評估
  • MIDI = 多影像域輸入
  • CDR = 杯盤比估計
  • N = 開槽
  • VF = 視野資訊/分割

公共青光眼影像資料集

數據集	訪問連結	無障礙	青光眼標籤？	使用案例
阿克瑞瑪	https://figshare.com/s/c2d31f850af14c5b5232	打開	是	巴格達公司
年齡	https://age.grand-challenge.org/Download/	登記	是	MGC、LT
BEH（孟加拉國眼科醫院）	https://github.com/mirtanvirislam/Deep-Learning-Based-Glaucoma-Detection-with-Cropped-Optic-Cup-and-Disc-and-Blood-Vessel-Segmentation/tree/master/Dataset	打開	是	巴格達公司
比奧米薩	https://data.mendeley.com/datasets/2rnnz5nz74/2	打開	是	MGC、BGC、MIDI、OLS、CDR
查克蘇影像	https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20123135	打開	是	巴格達公司
CRFO-v4	https://data.mendeley.com/datasets/trghs22fpg/4	打開	是	BGC、MDI、ODS、OCS
DR-HAGIS	https://personalpages.manchester.ac.uk/staff/niall.p.mcloughlin/	打開	是	BGC、BVS
DRIONS資料庫	https://www.researchgate.net/publication/326460478_Glaucoma_dataset__-_DRIONS-DB	打開	氮	消耗臭氧層物質
德里什蒂-GS1	https://cvit.iiit.ac.in/projects/mip/drishti-gs/mip-dataset2/Home.php	打開	是	BGC、ODS、OCS、CDR、N
EyePACS-AIROGS	https://airogs.grand-challenge.org/data-and-challenge/	打開	是	BGC、IQA
EyePACS-AIROGS-light (v1)	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/eyepacs-airogs-light	登記	是	巴格達公司
EyePACS-AIROGS-light (v2)	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/glaucoma-dataset-eyepacs-airogs-light-v2	登記	是	巴格達公司
五人組	https://figshare.com/articles/figure/FIVES_A_Fundus_Image_Dataset_for_AI-based_Vessel_Segmentation/19688169/1	打開	是	BGC、BVS
G1020	https://www.kaggle.com/datasets/arnavjain1/glaucoma-datasets	登記	是	BGC、ODS、OCS
伽瑪	https://gamma.grand-challenge.org/	登記	是	BGC?、ODS、OCS、OLS?、LT、MIDI
目標	https://ichallenges.grand-challenge.org/iChallenge-GON3/	登記	是	BGC、OLS
葡萄	https://springernature.figshare.com/collections/GRAPE_A_multi-modal_glaucoma_dataset_of_follow-up_visual_field_and_fundus_images_for_glaucoma_management/6406319/1	打開	是	MGC、心室顫動
哈佛-GF	https://ophai.hms.harvard.edu/datasets/harvard-glaucoma-fairness-3300-samples/	要求	氮	BGC、VF、RNFLS、MIDI
熱輻射	https://www5.cs.fau.de/research/data/fundus-images/	打開	是
INSPIRE-AVR-測試	https://medicine.uiowa.edu/eye/inspire-datasets	打開	氮
靈感立體聲	https://medicine.uiowa.edu/eye/inspire-datasets	打開	氮
JSIEC-1000	https://www.kaggle.com/datasets/linchundan/fundusimage1000	登記	是
KEH（金氏眼科醫院）	https://dataverse.harvard.edu/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.7910/DVN/1YRRAC	打開	是
落後	https://github.com/smilell/AG-CNN	要求	是
左旋AV	https://figshare.com/articles/dataset/LES-AV_dataset/11857698/1	打開	是
魯汶-海法 HRF	https://rdr.kuleuven.be/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.48804/Z7SHGO	要求	是	MGC、BVS
MSHF	https://www.nature.com/articles/s41597-023-02188-x#ref-CR17	打開	是	BGC、IQA
華僑電視台	https://zenodo.org/record/1481223#.Y20g3XbMIuV	打開	是
奧迪爾	https://www.kaggle.com/datasets/andrewmvd/ eyes-disease-recognition-odir5k	登記	是
國家衛生局	https://aldiri.info/Image%20Datasets/ONHSD.aspx	難以接近的	是
ORIGA-光	https://www.kaggle.com/datasets/sshikamaru/glaucoma-detection	登記	是
帕皮拉	https://doi.org/10.6084/m9.figshare.14798004.v1	打開	是
避難所1	https://refuge.grand-challenge.org/REFUGE2Download/	登記	是
避難所2	https://refuge.grand-challenge.org/REFUGE2Download/	登記	是
裡加-賓-拉什德	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	打開	氮
裡加-馬格拉比	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	打開	氮
裡加-梅西多爾	https://deepblue.lib.umich.edu/data/concern/data_sets/3b591905z	打開	氮
RIM-ONE-r1	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	打開	是
RIM-ONE-r2	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	打開	是
RIM-ONE-r3	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	打開	是
RIM-ONE-DL	http://medimrg.webs.ull.es/research/retinal-imaging/rim-one/	打開	是
SIGF	https://github.com/XiaofeiWang2018/DeepGF	要求	是
SMDG	https://www.kaggle.com/datasets/deathtrooper/multichannel-glaucoma-benchmark-dataset	登記	是
sjchoi86-HRF	https://github.com/yiweichen04/retina_dataset	打開	是
威瑞克	https://github.com/ProfMKD/Glaucoma-dataset	打開	是