D SCRIPT
v0.2.8: 2024-09-16 --
D-SCRIPT 是一種深度學習方法,用於在僅給出序列的情況下預測兩種蛋白質之間的物理相互作用。它可以很好地推廣到新物種,並且對於訓練資料大小的限制具有穩健性。它的設計反映了這樣的直覺:對於兩種蛋白質的物理相互作用,每種蛋白質的胺基酸子集應該與另一種蛋白質接觸。 D-SCRIPT 的中間階段直接實現了這種直覺,D-SCRIPT 的倒數第二階段是對蛋白質二聚體的蛋白質間接觸圖的粗略估計。這種結構驅動的設計增強了結果的可解釋性,由於結構在演化上比序列更保守,因此提高了跨物種的普遍性。
Sam Sledzieski、Rohit Singh、Lenore Cowen 和 Bonnie Berger 的論文「基於序列的蛋白質-蛋白質相互作用預測:結構感知的可解釋深度學習模型」中描述了 D-SCRIPT。
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