木蘭
1.0.0
歡迎來到 scMulan_v1 儲存庫,其中包含我們即將推出的工作:「scMulan:用於單細胞分析的多任務生成預訓練語言模型」。
scMulan 是一種用於分析單細胞轉錄組學的突破性基礎模型。
特徵:
conda create -n scMulan python==3.10
conda activate scMulan
pip install -r requirements.txt
下載ckpt檔案並將其放在./ckpt/下
準備好測試資料文件,然後開始使用 scMulan
我們提供了使用 scMulan 進行細胞類型註釋的教程(請參閱教程)。目前,scMulan 支持對心臟、肺、肝臟、骨髓、血液、大腦和胸腺等七個器官中的人類細胞類型進行零樣本註釋。
它還可用於取得用於批量整合的單元嵌入(請參閱教學課程)。您可以輕鬆使用您的數據並從 scMulan 獲取分析。
scMulan 現在支援 NPU 上的推理。