斯卡特
SKAT 是一種SNP 集（例如，基因或區域）水平測試，用於使用核機器方法獲取來自GWAS 和基因組的數據，以檢測一組罕見（或常見）變異與二分法（病例對照）或定量表型之間的關聯。 SKAT總結SNP集中SNP的個別得分測試統計數據，並有效計算SNP集水平p值，例如基因或區域水平p值，同時調整協變量，例如主成分，以考慮群體分層。 SKAT 還允許計算效力/樣本量，以設計序列關聯研究。
可用性
SKAT 可在 CRAN 上使用。請參閱項目頁面以了解更多資訊。
使用者群組
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參考
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- Lee, S.、Wu, MC 與 Lin, X. (2012)。定序關聯研究中罕見變異效應的最佳測試。生物統計學，13.4，762-775。 doi：10.1093/生物統計/kxs014。補充資料。
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