RAPD

RAPD

注意 - 該專案正在開發中並且處於前沿。代碼應該會在 2021 年 6 月顯著穩定。

用於大分子晶體學資料的自動索引、策略、整合、分析和結構解決方案的軟體包。

目前，我們正在建立命令列功能並向軟體添加檢測器。

目前命令：

• 分析 - 分析 MX 資料集並執行 pdbquery
• get_cif - 透過 4 字元代碼從 PDB 取得 CIF 文件
• get_pdb - 透過 4 個字元代碼從 PDB 取得 PDB 文件
• hdf5_to_cbf - 將 hdf5 檔案轉換為 CBF
• index - 索引 MX 資料並計算資料收集策略
• 整合 - 整合 MX 數據
• pdbquery - 將資料與輸入結構、常見污染物或 PDB 中具有相似晶胞參數的結構進行比較

開發者命令：

• 產生 - 建立新的 RAPD 模板文件
• print_ detector - 列印圖像檔案訊息
• python - 具有完整 RAPD 導入功能的 python CLI
• test - RAPD 專案的測試運行程序
• version - 列印目前安裝的 RAPD 版本
• xds_to_dict - 將 XDS.INP 轉換為 python 字典以包含在 RAPD 偵測器檔案中

目前支援的站點偵測器（更多即將推出）：

• APS

  • aps_gmca_dectris_eiger16m
  • lscat_dectris_eiger9m
  • lscat_rayonix_mx300
  • necat_dectris_eiger16m
  • necat_dectris_pilatus6mf
  • sercat_rayonix_mx300hs

• 加州大學洛杉磯分校

  • ucla_rigaku_raxisivpp

有關安裝和設定的說明，請參閱 install/README.md