lyprox

什麼是lyprox ？

它是一款 Django Web 應用程序，可顯示頭頸癌淋巴轉移的詳細模式，並允許人們更詳細地探索底層資料集。它託管在 URL https://lyprox.org 下。

動機

HNSCC 透過頸部淋巴系統擴散，並在區域淋巴結中形成轉移。肉眼可見的轉移可以透過 MRI、PET 和 CT 掃描等影像方式檢測。當選擇放射治療作為治療的一部分時，它們就會被包含在目標體積中。然而，顯微轉移太小，無法用目前的成像技術進行診斷。

為了解釋這種微觀受累，通常選擇性地照射部分淋巴系統以增強腫瘤控制。目前，哪些部分包含在該選擇性臨床目標體積中是根據指南^{1 2 3 4}決定的。這些又源自於每個淋巴結水平（LNL）的受累患病率的報告，即在任何給定的 LNL 中診斷出轉移的患者部分，按原發腫瘤位置分層。如果 10 - 15% 的患者表現出參與該特定水平，建議將 LNL 納入選擇性目標體積。

然而，雖然文獻中已經報告了受累的發生率^{5 6} ，並且一般的淋巴引流途徑也得到了很好的了解，但 HNSCC 的詳細進展模式仍然缺乏量化。我們認為，LNL 中微觀受累的風險在很大程度上取決於特定患者的具體診斷，因此如果能夠更好地量化進展模式，則可以對他們的治療進行個性化。

我們的目標

透過該介面，我們的主要目標是使提取的資料集易於存取。透過互動式視覺化，人們可以非常快速地測試或提出有關 HNSCC 淋巴擴散的假設。希望這反過來能激勵其他研究人員研究這些假設，提取並分享更多類似細節的數據。

這反過來又將使我們（或任何人，實際上）能夠建立更準確和精確的腫瘤進展模型。例如，就像之前使用貝葉斯網路預測個人化參與機率的工作⁷或我們最近在這個問題上使用隱馬可夫模型發表的文章，從而引入了一種顯式的時間建模方法⁸ 。

淋巴進展模式資料集

在此介面中可視化的資料獨立存在於一個開源儲存庫中：lyDATA。

我們也在Raditherapy & Oncology ⁹中發表了一篇關於資料集和介面的論文，預印本可在medRxiv ¹⁰上取得。

個性化 CTV 定義的機率模型

我們也研究可預測頭頸癌淋巴擴散的機率模型^{7 8} 。底層程式碼託管在另一個儲存庫：lymph。

如何貢獻

您可以透過兩種方式為該專案做出貢獻：

1. 如果您是該領域的臨床研究人員並希望與我們分享您的數據，請透過電子郵件與我們聯繫：[email protected]。
2. 另一種方法是為該儲存庫做出貢獻，例如，如果您是軟體開發人員。我想這有點不太可能，因為這個 Django 應用程式的範圍非常具體，但我們仍然歡迎任何貢獻。在這種情況下，可以在 GitHub 頁面上找到原始程式碼的詳細文件。

本機運行該介面

如果您想自行託管資料或嘗試資料在 Web 應用程式中的顯示效果而無需上傳，請隨時按照這些說明在本機上啟動並執行資料。

註腳

1. Vincent Grégoire 等人，頭頸適形放射治療中淋巴結標靶區的選擇與描繪。基於手術經驗的術語和程序標準化提案，放射治療和腫瘤學，卷。 56，第 135-150 頁，2000 年，doi：https://doi.org/10.1016/S0167-8140(00)00202-4。 ↩

2. Vincent Grégoire、A. Eisbruch、M. Hamoir 和 P. Levendag，關於在淋巴結陽性和術後頸部描繪淋巴結 CTV 的提案，放射治療和腫瘤學，卷。 79，沒有。 1，第 15-20 頁，2006 年 4 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2006.03.009。 ↩

3. Vincent Grégoire 等人，頭頸部腫瘤頸部淋巴結水平的劃分：2013 年更新。 DAHANCA、EORTC、HKNPCSG、NCIC CTG、NCRI、RTOG、TROG 共識指南，放射治療和腫瘤學，卷。 110，不。 1，第 172-181 頁，2014 年 1 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2013.10.010。 ↩

4. Julian Biau 等人，明確頭頸放射治療的淋巴結靶區選擇：2019 年更新，放射治療和腫瘤學，卷。 134，第 1-9 頁，2019 年 5 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2019.01.018。 ↩

5. 賈廷。 P. Shah、FC Candela 和 AK Poddar，口腔鱗狀細胞癌頸部淋巴結轉移的模式，癌症，卷。 66，沒有。 1，第 109-113 頁，1990 年，doi：https://doi.org/10.1002/1097-0142(19900701)66:1%3C109::AID-CNCR2820660120%3E3.0.CO;2-A。 ↩

6. Laurence Bauwens 等人， HPV 陽性和 HPV 陰性口咽鱗狀細胞癌中頸部淋巴結轉移的患病率和分佈，放射治療和腫瘤學，卷。 157，第 122-129 頁，2021 年 4 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2021.01.028。 ↩

7. Bertrand Pouymayou、P. Balermpas、O. Riesterer、M. Guckenberger 和 J. Unkelbach，用於頭頸癌個性化選擇性 CTV 定義的淋巴腫瘤進展貝葉斯網絡模型，醫學與生物學物理學，卷。 64，沒有。 16，p。 165003，2019 年 8 月，doi：https://doi.org/10.1088/1361-6560/ab2a18。 ↩ ↩ ²

8. Roman Ludwig、B. Pouymayou、P. Balermpas 和 J. Unkelbach，頭頸部淋巴腫瘤進展的隱馬可夫模型， Sci Rep ，卷。 11、沒有。 1，p。 12261，2021 年 12 月，doi：https://doi.org/10.1038/s41598-021-91544-1。 ↩ ↩ ²

9. Roman Ludwig 等人，透過線上介面詳細報告口咽鱗狀細胞癌淋巴結受累情況，放射治療和腫瘤學，2022 年 2 月，doi：https://doi.org/10.1016/j.radonc.2022.01 .035 . ↩

10. 羅曼·路德維希，J.-M. Hoffmann, B. Pouymayou 等人，透過線上介面詳細報告口咽鱗狀細胞癌淋巴結受累的患者個體， medRxiv ，2021 年 12 月。 ↩