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XOLOTL：快速且靈活的神經元模擬器

xolotl是一個快速的單個室和多室模擬器，用C++編寫的MATLAB接口編寫，您將實際使用。

為什麼要使用Xolotl？這就是為什麼：

Xolotl很快

Xolotl用C ++編寫，而且很快。在我們的測試中，單室神經元的神經元比神經元快3倍。

Xolotl易於使用

是否要設置Hodgkin-Huxley模型，注入電流，集成並繪製電壓跟踪？這就是您所需要的：

x = xolotl ;
x .add( ' compartment ' , ' HH ' , ' A ' , 0.01 );
x . HH .add( ' liu/NaV ' , ' gbar ' , 1000 );
x . HH .add( ' liu/Kd ' , ' gbar ' , 300 );
x . HH .add( ' Leak ' , ' gbar ' , 1 );
x.I_ext = .2 ;
x . plot ;

Xolotl具有文檔

與某些無名的神經元模擬器不同，Xolotl的文檔實際上存在。

這就是它的樣子：

Xolotl是完全可編程的

Xolotl設計用於從MATLAB內使用。它為您提供了兩全其美的最好：C ++彙編的代碼的高性能具有Matlab所提供的所有工具箱的豐富功能。你可以：

編寫將模型作為參數傳遞的功能
使用全局優化工具箱優化神經元模型的參數
在多台計算機上並行運行模擬
有一個單個腳本來運行模擬並分析結果

迷上了？開始這裡。

我在哪裡得到這個？

單擊此處下載，然後單擊下載的文件以安裝。

我如何引用這個？

我們已經在神經信息學方面發表了一份技術報告。

 @ARTICLE{10.3389/fninf.2018.00087,
AUTHOR={Gorur-Shandilya, Srinivas and Hoyland, Alec and Marder, Eve},   
TITLE={Xolotl: An Intuitive and Approachable Neuron and Network Simulator for Research and Teaching},      
JOURNAL={Frontiers in Neuroinformatics},      
VOLUME={12},      
PAGES={87},     
YEAR={2018},      
URL={https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fninf.2018.00087},       
DOI={10.3389/fninf.2018.00087},      
ISSN={1662-5196},   
}