tIGAr

蒂加爾

使用Fenics用於等幾何分析（IGA）的Python庫。以下文章概述了Tigar的設計：

 @article{Kamensky2019,
title = "{tIGAr}: Automating isogeometric analysis with {FEniCS}",
journal = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
volume = "344",
pages = "477--498",
year = "2019",
issn = "0045-7825",
doi = "https://doi.org/10.1016/j.cma.2018.10.002",
author = "D. Kamensky and Y. Bazilevs"
}

依賴性

• 任何有意義的用法都需要Fenics（2019.2版）及其依賴性。
• 需要Scipy。 （Scipy已經包含在Fenics Docker發行中。）
• 使用NURBS模塊需要Igakit。
• 編譯API文檔需要獅身人面像。
• 可視化結果的最方便程序是瀏覽器。

安裝

安裝所有依賴項，克隆存儲庫（或從存檔中下載和提取），然後將存儲庫的頂級目錄（即帶有tigar subdectories tIGAr ， docs等）的頂級目錄附加到環境變量PYTHONPATH ，例如，例如，例如添加

 export PYTHONPATH=/path/to/repository/: $PYTHONPATH

到您的~/.bashrc文件（以及source -ing it）。 （可選地）構建API文檔，將目錄更改為docs並鍵入make html 。然後，主要文檔將在./_build/html/index.html中，可以使用Web瀏覽器打開。

在集群上

在HPC群集上使用Fenics（以及Tigar）的最方便方法是通過奇異性。用於使用Tigar的奇異性配方是在文件singularity-recipe.def中。該文件的評論中還提供了一些其他註釋。

常見的安裝問題

• petsc4py.PETSc.Mat object has no attribute PtAP ：這是由於petsc4py的舊版本所致。嘗試通過pip3安裝最新版本。
• ImportError: No module named dolfin ：嘗試使用python而不是python3時會發生這種情況。 Fenics 2018.1和新的不再支持Python 2。
• Python.h: No such file or directory ：這需要安裝Python C API的標頭文件。在Ubuntu上，可以通過sudo apt-get install python3-dev安裝它們。
• ModuleNotFoundError: No module named 'scipy._lib.decorator' ：嘗試重新安裝scipy，可以使用command pip3 install --force-reinstall scipy來完成。
• 由於舊版本的Fenics：在終端中運行dolfin-version引起的錯誤，以檢查您的Fenics版本。特別注意，僅在最近的少數Ubuntu發行版中維護了當前穩定版本的Fenics的Ubuntu PPA。通過包裝管理器在舊的Ubuntu版本上安裝，可能會安裝舊版本的Fenics。
• 使用奇異容器時， libgfortran.so.3 cannot be found或libgfortran的其他問題：嘗試在文件singularity-recipe.def中的%post部分下添加apt-get -y install libgfortran3 。