一、策略玩法
策略玩法，布陣、羈絆追打、風雷水火土五類屬性、敘事技能都值得仔細研究。遊戲的戰鬥以小隊的形式展開，所以布陣十分重要的。布陣過程中，你能搭配自己扮演的角色以外的其他忍者的陣容、站位。為了和其他忍者密切配合，你需要靈活調整自己角色的天賦。
二、劇情副本
《火影忍者OL-忍者新世代》提供了豐富多樣的玩法，例如劇情困難英雄副本、忍者考試、忍者集訓、豐饒之間、生存探險、競技場、組隊副本、組織戰等。你能透過這些玩法享受各種類型的戰鬥，並獲得忍者、裝備、經驗、貨幣等獎勵，這些獎勵能有效擴充你的忍者陣容並提升忍者戰力。如果你追求強度，那麼務必全力攻略這些玩法。因為不同玩法差異很大，難度會逐漸遞增，所以你要仔細布陣，確保能獲得完全勝利。
三、宅基計劃
在忍者部屋系統上線同期，還將推出宅基計劃主題活動，在宅基計劃中，引入了“區域繁榮度”這個概念，旨在提升學員們對房屋所在的區域的歸屬感，在宅基計劃中，學員們要對房屋進行升級，透過賺錢、委託等操作來增加區域繁榮度。當區域繁榮度達到一定數值即可獎勵可領取。