com.scMulan
1.0.0
مرحبًا بك في مستودع scMulan_v1، الذي يعرض عملنا القادم: "scMulan: نموذج لغة مولد متعدد المهام ومدرب مسبقًا لتحليل الخلية الواحدة."
يعد scMulan نموذجًا أساسيًا رائدًا لتحليل نسخ الخلايا المفردة.
سمات:
conda create -n scMulan python==3.10
conda activate scMulan
pip install -r requirements.txt
قم بتنزيل ملف ckpt ووضعه تحت ./ckpt/
قم بإعداد ملف adata الخاص بالاختبار، وابدأ في استخدام scMulan
لقد قدمنا برنامجًا تعليميًا لاستخدام scMulan للتعليق التوضيحي لنوع الخلية (انظر البرنامج التعليمي). حاليًا، يدعم scMulan شرحًا توضيحيًا لأنواع الخلايا البشرية في سبعة أعضاء بما في ذلك القلب والرئة والكبد ونخاع العظام والدم والدماغ والغدة الصعترية.
يمكن استخدامه أيضًا للحصول على تضمينات الخلايا لتكامل الدُفعات (انظر البرنامج التعليمي). يمكنك بسهولة استخدام بياناتك والحصول على التحليل من scMulan.
يدعم scMulan الآن الاستدلال على npu.
