tIGAr

Tigar

Perpustakaan Python untuk analisis isogeometrik (IGA) menggunakan fenics. Artikel berikut menguraikan desain Tigar:

 @article{Kamensky2019,
title = "{tIGAr}: Automating isogeometric analysis with {FEniCS}",
journal = "Computer Methods in Applied Mechanics and Engineering",
volume = "344",
pages = "477--498",
year = "2019",
issn = "0045-7825",
doi = "https://doi.org/10.1016/j.cma.2018.10.002",
author = "D. Kamensky and Y. Bazilevs"
}

Dependensi

• Penggunaan yang bermakna membutuhkan Fenics (versi 2019.2) dan ketergantungannya.
• SCIPY diperlukan. (SCIPY sudah termasuk dalam distribusi Docker Fenics.)
• Penggunaan modul NURBS membutuhkan Igakit.
• Mengkompilasi dokumentasi API membutuhkan sphinx.
• Program yang paling nyaman untuk memvisualisasikan hasil adalah paraview.

Instalasi

Instal semua dependensi, klon repositori (atau unduh dan ekstrak dari arsip), dan tambahkan direktori tingkat atas repositori (yaitu. Yang dengan subdirektori tIGAr , docs , dll.) Ke variabel lingkungan PYTHONPATH , mis. menambahkan

 export PYTHONPATH=/path/to/repository/: $PYTHONPATH

ke file ~/.bashrc Anda (dan source -ing). Untuk (secara opsional) membangun dokumentasi API, ubah direktori ke docs dan ketik make html . Dokumentasi utama kemudian akan berada di ./_build/html/index.html , yang dapat dibuka dengan browser web.

Pada kelompok

Cara paling nyaman untuk menggunakan Fenics (dan karenanya Tigar) pada kelompok HPC adalah melalui singularitas. Resep singularitas untuk menggunakan Tigar ada dalam file singularity-recipe.def . Beberapa catatan tambahan disediakan di komentar file itu.

Masalah instalasi umum

• petsc4py.PETSc.Mat object has no attribute PtAP : Ini karena versi lama petsc4py . Coba instal versi terbaru melalui pip3 .
• ImportError: No module named dolfin : Ini terjadi ketika mencoba menggunakan python daripada python3 . Fenics 2018.1 dan yang lebih baru tidak lagi mendukung Python 2.
• Python.h: No such file or directory : Ini memerlukan menginstal file header untuk Python C API. Di Ubuntu, ini dapat diinstal melalui sudo apt-get install python3-dev .
• ModuleNotFoundError: No module named 'scipy._lib.decorator' : coba instalasi ulang Scipy, yang dapat dilakukan dengan perintah pip3 install --force-reinstall scipy .
• Kesalahan karena versi Fenics lama: Jalankan dolfin-version di terminal untuk memeriksa versi Fenics Anda. Perhatikan khususnya bahwa PPA Ubuntu untuk versi fenik yang stabil saat ini hanya dipertahankan untuk beberapa rilis Ubuntu terbaru. Menginstal melalui Paket Manajer pada rilis Ubuntu lama dapat menginstal versi Fenics yang lebih lama.
• libgfortran.so.3 cannot be found , atau masalah lain dengan libgfortran saat menggunakan wadah singularitas: coba tambahkan apt-get -y install libgfortran3 di bawah bagian %post dalam file singularity-recipe.def .