xolotlダウンロードxolotlソースコードのダウンロード

xolotl

その他のソースコード

binaries

ダウンロード

Xolotl：高速で柔軟なニューロンシミュレーター

xolotlは、 C++で記述された高速シングルコンパートメントおよびマルチコンパートメントシミュレーターで、実際に使用しているMATLABインターフェイスを使用しています。

なぜxolotlを使用するのですか？これが理由です：

xolotlは速いです

XolotlはC ++で書かれており、高速です。私たちのテストでは、単一のコンパートメントニューロンのニューロンの3倍以上速いです。

Xolotlは使いやすいです

Hodgkin-Huxleyモデルをセットアップし、電流を注入し、それを統合し、電圧トレースをプロットしたいですか？これはあなたが必要とするすべてです：

x = xolotl ;
x .add( ' compartment ' , ' HH ' , ' A ' , 0.01 );
x . HH .add( ' liu/NaV ' , ' gbar ' , 1000 );
x . HH .add( ' liu/Kd ' , ' gbar ' , 300 );
x . HH .add( ' Leak ' , ' gbar ' , 1 );
x.I_ext = .2 ;
x . plot ;

Xolotlにはドキュメントがあります

Xolotlには、名前のないままである特定の広く使用されているニューロンシミュレーターとは異なり、実際に存在するドキュメントがあります。

これがどのように見えるかです：

Xolotlは完全にプログラム可能です

Xolotlは、Matlab内から使用するように設計されています。それはあなたに両方の世界の最高を与えます：MATLABが提供するすべてのツールボックスの豊富なパワーを持つC ++コンパイルされたコードの高性能。あなたはできる：

モデルを引数として渡す関数を書き込みます
グローバル最適化ツールボックスを使用して、ニューロンモデルのパラメーターを最適化する
複数のコンピューターでシミュレーションを並行して実行します
シミュレーションを実行して結果を分析するための単一のスクリプトを持っています

フック？ここから始めましょう。

これはどこで入手できますか？

ここをクリックしてダウンロードし、ダウンロードしたファイルをクリックしてインストールしてください。

これを引用するにはどうすればよいですか？

NeuroinformaticsのFrontiersでテクノロジーレポートを公開しました。

 @ARTICLE{10.3389/fninf.2018.00087,
AUTHOR={Gorur-Shandilya, Srinivas and Hoyland, Alec and Marder, Eve},   
TITLE={Xolotl: An Intuitive and Approachable Neuron and Network Simulator for Research and Teaching},      
JOURNAL={Frontiers in Neuroinformatics},      
VOLUME={12},      
PAGES={87},     
YEAR={2018},      
URL={https://www.frontiersin.org/article/10.3389/fninf.2018.00087},       
DOI={10.3389/fninf.2018.00087},      
ISSN={1662-5196},   
}