これは、GPSのデータ管理および視覚化ツールを備えたRパッケージのリポジトリと、動物を追跡するための加速度計データ(牛など)です。関連する空間的データを視覚化および分析するための2つの光沢のあるアプリが含まれています。
関数の使用に関する詳細については、PDFマニュアルを参照してください。
アニマルトラッカーアプリには、デモデータが含まれています。または、ZIPフォルダーに独自の.csvまたは.txt動物データファイルを便利にアップロードします。ファイルがアップロードされた後、アプリが悪いデータポイントをフィルタリングするオプションがあります。ろ過パラメーターを構成し、オプションでカルマンクラスタリングアルゴリズムを使用してクラスターを構成できます。
デフォルトでは、標高の検索は、アップロードされたデータを解析することから決定される最大/最小緯度と経度によって制限されますが、境界は手動で変更できます。これらの境界は、ろ過メニューからのカルマンクラスタリングにも影響します。同様に、ズームレベルは現在のマップズームにデフォルトですが、1〜14から値に手動で変更することもできます。チェックボックスをクリックして、斜面と標高のあるアスペクトを含めます。
ドロップダウン選択を使用して、サイト、動物、または日付範囲でフィルタリングします。アプリ機能は選択に基づいて動的に更新され、フィルタリングされたデータもダウンロードとして利用できます。
さらに、アニマルトラッカーは動物のデータから地形を視覚化できます。ポイントビューとヒートマップビューを切り替えるか、両方をオーバーレイします。長方形を描画して、特定の領域を選択します。
動物トラッカーはまた、動物の行動を視覚化して比較します。プロットには、動物による時間の経過とともに上昇し、動物によるサンプルのポイント数、動物による移動速度と場所で費やされる合計時間(図示せず)が含まれます。
このアプリには、視覚化を補完する統計的要約ユーティリティが付属しています。標高、GPS測定の時間差、コース、GPS測定値のコースの違い、距離、および要約するレートを選択します。次に、サンプルサイズ、平均、中央値、標準偏差、分散、最小値、最大値、範囲、四分位範囲、第1四分位、3番目の四分位統計から選択します。
2つのデータセットを検証アプリと並べて比較して視覚化します。含まれているデモデータセットを使用してアプリを試してみるか、独自の.csvファイルをアップロードします(.txtはまだサポートされていません)。
外れ値の検出も適用できます。現在、Iglewicz and Hoaglin(1993)によると、変更されたZスコア分類をサポートしています。
さらに、アプリの外れ値検出からのフラグ付きデータまたはアップロード前にデータに既に適用されているメソッドについては、要約統計が提供されています。
このアプリは、rstudio(または基本的なRコンソール)をインストールして実行できます。
アニマルトラッカーをインストールする前に、devtoolsパッケージをインストールしてロードしていることを確認してください。
install.packages("devtools")
library(devtools)
以下を実行して動物トラッカーをインストールしてロードします。
install_github("mathedjoe/animaltracker")
library(animaltracker)
以下を実行してコアシャイニーアプリを起動します。
run_shiny_animaltracker()
以下を実行して、検証Shinyアプリを起動します。
run_validation_app()
[email protected]にメールしてください。