Este é um repositório para um pacote R com ferramentas de gerenciamento e visualização de dados para dados de GPS e acelerômetro para rastrear animais (por exemplo, vacas). Inclui dois aplicativos brilhantes para visualizar e analisar os dados espaciais-temporais associados.
Consulte o manual do PDF para obter informações detalhadas sobre o uso da função.
O aplicativo de rastreador de animais é fornecido com dados de demonstração incluídos. Ou, envie convenientemente seus próprios arquivos de dados de animais .csv ou .txt em uma pasta ZIP. Há uma opção para o aplicativo filtrar pontos de dados ruins após o upload dos arquivos. Você pode configurar os parâmetros de filtragem e opcionalmente agrupar com um algoritmo de cluster de Kalman.
Por padrão, a pesquisa de elevação é delimitada pela latitude e longitude máxima/mínima determinadas ao analisar os dados carregados, mas os limites podem ser modificados manualmente. Esses limites também afetam o agrupamento de Kalman no menu de filtração. Da mesma forma, o nível de zoom padrão no zoom atual do mapa, mas também pode ser alterado manualmente para valores de 1 a 14. Clique nas caixas de seleção para incluir inclinação e aspecto com elevação.
Use as seleções suspensas para filtrar por local, animal ou intervalo de data. Os recursos do aplicativo serão atualizados dinamicamente com base em suas seleções e os dados filtrados também estão disponíveis como download.
Além disso, o rastreador de animais pode visualizar o terreno a partir de seus dados de animais. Alterne entre as vistas do ponto e do mapa de calor ou sobreponha ambos. Desenhe um retângulo para selecionar uma região específica.
O rastreador de animais também visualiza e compara os comportamentos de seus animais. As parcelas incluem elevação ao longo do tempo por animal e número de pontos na amostra por animal, bem como a taxa de viagem por animal e tempo total gasto por local (não mostrado).
O aplicativo vem com um utilitário de resumo estatístico para complementar as visualizações. Escolha entre elevação, diferença de tempo entre medições de GPS, curso, diferença de curso entre medições de GPS, distância e taxa para resumir. Em seguida, selecione o tamanho da amostra, média, mediana, desvio padrão, variação, valor mínimo, valor máximo, intervalo, intervalo interquartil, primeiro quartil e terceira estatísticas de quartil.
Compare e visualize dois conjuntos de dados lado a lado com o aplicativo de validação. Experimente o aplicativo com os conjuntos de dados de demonstração incluído ou faça o upload de seus próprios arquivos .csv (.txt ainda não foi suportado).
A detecção externa também pode ser aplicada. Atualmente, apoiamos a classificação modificada do escore z de acordo com Iglewicz e Hoaglin (1993).
Além disso, as estatísticas resumidas são fornecidas para dados sinalizados da detecção outlier do aplicativo ou de um método já aplicado aos dados antes do upload.
Este aplicativo pode ser instalado e executado no RSTUDIO (ou pelo console R Basic R).
Antes de instalar o rastreador de animais, verifique se você tem o pacote Devtools instalado e carregado:
install.packages("devtools")
library(devtools)
Instale e carregue o AnimalTracker executando o seguinte:
install_github("mathedjoe/animaltracker")
library(animaltracker)
Inicie o aplicativo Core Shiny executando o seguinte:
run_shiny_animaltracker()
Inicie o aplicativo de validação brilhante executando o seguinte:
run_validation_app()
Envie um e -mail para [email protected].