納帕里空間數據
0.5.3
此儲存庫包含一個 napari 插件，用於互動式探索和註解 SpatialData 物件。在這裡您可以找到 napar-spatialdata 文件。 napari-spatialdata是SpatialData生態系統的一部分。要了解有關 SpatialData 的更多信息，請參閱 SpatialData 文件。
您可以透過pip安裝napari-spatialdata ：
pip install napari-spatialdata[all]
all指令將安裝 qt 綁定PyQt5 。
您可以在安裝說明中找到更多詳細資訊。
如果您想使用該插件作為預設的 zarr 閱讀器，請在 napari 中轉到File -> Preferences -> Plugins ，然後按照File extension readers下的說明進行操作。
您可以使用以下指令從 Github 安裝napari-spatialdata ：
pip install git+https://github.com/scverse/napari-spatialdata
或者，您也可以在克隆儲存庫後以可編輯模式安裝：
git clone https://github.com/scverse/napari-spatialdatacd napari-spatialdatapip install -e .
注意：當執行可編輯的napari-spatialdata安裝時， spatialdata將從pip重新安裝。因此，如果您之前也對spatialdata進行了可編輯安裝，則需要重新執行pip install -e .在spatialdata資料庫上。請在安裝說明中找到更多詳細資訊。
若要了解如何使用napari-spatialdata插件，請參閱文件。若要了解如何將 napar-spatialdata 整合到您的分析工作流程中，請參閱 SpatialData 教學課程。尤其：
用 napari 註釋感興趣的區域
使用地標註釋來對齊多個組學層
非常歡迎您的貢獻。測試可以使用 tox 運行，請確保在提交拉取請求之前覆蓋範圍至少保持不變。
「napari-spatialdata」根據 BSD-3 授權條款分發，是免費開源軟體
如果您遇到任何問題，請提交問題並附上詳細說明。
Marconato, L.、Palla, G.、Yamauchi, KA 等人。 SpatialData：一個開放且通用的空間組學資料框架。自然方法（2024）。 https://doi.org/10.1038/s41592-024-02212-x
