歡迎使用 elastix:用於影像剛性和非剛性配準的工具箱。
elastix 是開源軟體,基於著名的 Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK)。該軟體由一組常用於執行(醫學)影像配準的演算法組成:透過優化相關影像相似性度量,找到空間變換、將一個影像(固定影像)映射到另一個影像(移動影像)的任務。 elastix的模組化設計允許使用者針對特定應用快速配置、測試和比較不同的註冊方法。命令列介面可以透過腳本自動處理大量資料集。如今,elastix 與 ITKElastix 一起提供了 Python(在 Pypi 上)版本,而 SimpleElastix 則提供了 C++、Python、Java、R、Ruby、C# 和 Lua 等語言版本。 dockerhub 上也提供了最新 elastix 版本的 docker 映像。對於那些希望在圖形使用者介面中使用 elastix 功能的人來說,有幾個插件可供使用,其中包括 napar 和 3Dslicer 插件。
elastix 的主要開發人員是 Stefan Klein 和 Marius Staring。該軟體最初是在 Josien PW Pluim 的監督下在影像科學研究所開發的。如今,許多人都為 elastix 做出了貢獻。
如果您在任何地方使用該軟體,如果您引用以下文章,我們將不勝感激:
elastix的具體成分由多種成分組成;相關引用可以在這裡找到。此外,您可以使用 Zenodo 的 elastix DOI 識別碼來引用特定的軟體版本:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.13366181
更多信息,包括詳盡的手冊和模型動物園,可以在維基上找到
Jupyter 筆記本中提供了互動式教學。
您也可以訂閱郵件清單來提問。有關為elastix
做出貢獻的資訊可以在此處找到。