dimple

酒窩

大分子晶體學管道用於細化和配體篩選。

請參閱http://ccp4.github.io/dimple的文檔

安裝

Dimple是CCP4套件的一部分。所有工作都是由套件的其他程序完成的，這些程序在下面運行。最重要的是RefMac和Phaser 。因此，您需要安裝CCP4。

要測試最新的開發版本，請克隆此存儲庫並運行./dimple/dimple 。

Dimple帶有一點find-blobs實用程序。如果您不編譯它，則將使用CCP4套件的版本。彙編需要剪裁庫，依次需要MMDB2和LIBCCP4。您可以構建從源來構建所有內容，或者使用Conda下載使用GCC 4.8編譯的二進製文件。後者可以通過安裝minconda並進行：

 conda install -c mw clipper

而不是構建查找鍵指向所需庫的位置：

 export CXXFLAGS="-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 -std=c++98"  # for GCC 5
cmake -D CMAKE_PREFIX_PATH=$HOME/miniconda2 .
make

無需進行安裝 - 與Python腳本和DIMPLE相同的目錄中的二進制降落在此目錄中，將首先使用$CCP4/bin的程序。

如果不起作用 - 請參見下面的聯繫方法。

評論？

歡迎任何想法，評論或反饋。如果它無法正常工作或根本不起作用 - 請盡快知道。使用問題跟踪器或電子郵件CCP4幫助台或發送電子郵件至[email protected]或。

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用鑽石光源和CCP4-Harwell製造。