與其他網路行銷方法比較，搜尋引擎行銷具有自身的一些特點，充分了解這些特點可以更有效地利用搜尋引擎進行網路行銷。
(1)搜尋引擎行銷方法與企業網站密不可分。企業網站推廣是搜尋引擎行銷的主要目的之一，因此，專業的企業網站的建立是企業有效地開展搜尋引擎行銷的主要依托，企業網站的專業性以及搜尋引擎的友善性會對搜尋引擎行銷的效果產生直接的影響。
(2)搜尋引擎行銷是一種用戶主導的網路行銷。使用搜尋引擎檢索資訊的行為是由使用者主動發生的，使用者檢索什麼資訊或服務也完全是根據自己的需求和意願決定的，而且使用者在搜尋結果中選擇那些資訊也是有自己的偏好和判斷，並不受其他因素的影響，因此，搜尋引擎行銷是由用戶所主導的，行銷活動本身對用戶的影響被減少到了最低的限度。
(3)搜尋引擎行銷可以達到較高程度的定位。網路行銷的主要特點之一是可以對使用者行為進行準確分析並實現高程度定位，尤其是在搜尋結果頁面的關鍵字廣告，完全可以實現與使用者所檢索的關鍵字高度相關，從而提高行銷訊息被關注的程度，最終達到網路行銷效果的目的。
(4)搜尋引擎行銷的效果主要表現為行銷網站流量的增加。以企業網站推廣為目的的搜尋引擎行銷的主要任務是提高網站的訪問量，至於訪問量的增加最終是否能轉化為收益的增加，還取決於其他一些因素，這是搜尋引擎行銷活動所無法決定的。
(5)搜尋引擎行銷需要適應網路服務環境的發展變化。搜尋引擎行銷是在具體的網路環境下對搜尋引擎的具體應用，因此對搜尋引擎的工作原理和服務模式等網路環境的依賴性較高。當搜尋引擎的檢索方式和服務模式改變時，搜尋引擎行銷也應該做出相應的改變，搜尋引擎行銷應保持與網路行銷服務環境的協調一致。