สคมู่หลาน
1.0.0
ยินดีต้อนรับสู่พื้นที่เก็บข้อมูลสำหรับ scMulan_v1 ซึ่งมีผลงานที่กำลังจะมาถึงของเรา: "scMulan: โมเดลภาษาที่ได้รับการฝึกอบรมล่วงหน้าแบบมัลติทาสก์สำหรับการวิเคราะห์เซลล์เดียว"
scMulan เป็นแบบจำลองพื้นฐานที่ก้าวล้ำสำหรับการวิเคราะห์ทรานสคริปโทมิกส์เซลล์เดียว
คุณสมบัติ:
conda create -n scMulan python==3.10
conda activate scMulan
pip install -r requirements.txt
ดาวน์โหลดไฟล์ ckpt และวางไว้ใต้ ./ckpt/
เตรียมไฟล์ Adata ทดสอบของคุณ และเริ่มใช้ scMulan
เราได้จัดเตรียมบทช่วยสอนเกี่ยวกับการใช้ scMulan สำหรับคำอธิบายประกอบประเภทเซลล์ (ดูบทช่วยสอน) ในปัจจุบัน scMulan รองรับคำอธิบายประกอบประเภทเซลล์ของมนุษย์ในอวัยวะทั้งเจ็ดซึ่งรวมถึงหัวใจ ปอด ตับ ไขกระดูก เลือด สมอง และไธมัส
นอกจากนี้ยังสามารถใช้เพื่อรับการฝังเซลล์สำหรับการรวมแบทช์ได้ (ดูบทช่วยสอน) คุณสามารถใช้ adata และรับการวิเคราะห์จาก scMulan ได้อย่างง่ายดาย
ตอนนี้ scMulan รองรับการอนุมานบน npu
