AI工具精準描述細胞代謝狀態

作者：Eve Cole 更新時間：2024-11-22 19:00:01

科技日報北京9月3日電(記者張夢然)瑞士洛桑聯邦理工學院領導的團隊創建了一個基於AI的工具RENAISSANCE，其可結合各種類型的細胞數據，準確描述細胞代謝狀態，從而幫助人們更精準地理解細胞功能。 RENAISSANCE是計算生物學的重大進步，為健康研究和生物技術創新開闢了新途徑。現代生物學產生了大量有關各種細胞活動的資料集。這些數據集提供了對不同細胞功能的洞察，例如基因活動和蛋白質水平。然而，如何整合和理解這些數據集以了解細胞代謝，一直是一項高難度挑戰。動力學模型透過對細胞代謝的數學表達，提供了一種解讀複雜數據的新方法。它們可作為詳細的地圖，描述分子在細胞內如何相互作用和轉化，以及物質如何隨著時間的推移轉化為能量和其他產物。此次團隊利用RENAISSANCE創建了準確反映大腸桿菌代謝行為的動力學模型。該工具成功產生了與實驗中觀察到的代謝行為相匹配的模型，模擬了細菌在生物反應器中如何隨時間調整其代謝。研究同時證明，即使受到遺傳和環境條件的干擾，動力學模型也能保持穩定。模型能可靠地預測細胞對不同情境的反應，進而增強其在研究和工業應用上的實際效用。團隊表示，代謝組學和蛋白質組學只能檢測和量化有限數量的代謝物和蛋白質，這會帶來數據覆蓋不足的問題。能整合和協調各種來源資料的建模技術，則可彌補此限制並增強對整個生命系統的理解。從長遠角度來看，RENAISSANCE能準確模擬細胞代謝具有重大意義，它為人類研究代謝變化提供了強大的工具，並有助於開發新的治療方法和生物技術。